Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APAF1O14727 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APAF1O14727 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APAF1O14727 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APAF1O14727 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APAF1O14727 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APAF1O14727 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APAF1O14727 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APAF1O14727 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APAF1O14727 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APAF1O14727 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APAF1O14727 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APAF1O14727 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APAF1O14727 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APAF1O14727 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APAF1O14727 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
APAF1O14727 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APAF1O14727 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APAF1O14727 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APAF1O14727 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APAF1O14727 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APAF1O14727 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
APAF1O14727 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APAF1O14727 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APAF1O14727 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APAF1O14727 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APAF1O14727 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APAF1O14727 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APAF1O14727 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APAF1O14727 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APAF1O14727 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APAF1O14727 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APAF1O14727 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APAF1O14727 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
APAF1O14727 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APAF1O14727 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APAF1O14727 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APAF1O14727 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APAF1O14727 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APAF1O14727 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APAF1O14727 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APAF1O14727 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APAF1O14727 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APAF1O14727 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APAF1O14727 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APAF1O14727 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APAF1O14727 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APAF1O14727 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APAF1O14727 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
APAF1O14727 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APAF1O14727 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APAF1O14727 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APAF1O14727 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APAF1O14727 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APAF1O14727 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APAF1O14727 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APAF1O14727 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APAF1O14727 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APAF1O14727 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APAF1O14727 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APAF1O14727 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APAF1O14727 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APAF1O14727 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APAF1O14727 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APAF1O14727 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms