Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WIPF3A6NGB9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms