Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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C5orf49A4QMS7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C5orf49A4QMS7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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C5orf49A4QMS7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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C5orf49A4QMS7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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C5orf49A4QMS7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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C5orf49A4QMS7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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C5orf49A4QMS7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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C5orf49A4QMS7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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C5orf49A4QMS7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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C5orf49A4QMS7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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C5orf49A4QMS7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C5orf49A4QMS7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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