Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms