Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms