Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms