Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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