Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms