Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALCOCO1Q9P1Z2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CALCOCO1Q9P1Z2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALCOCO1Q9P1Z2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CALCOCO1Q9P1Z2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALCOCO1Q9P1Z2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALCOCO1Q9P1Z2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALCOCO1Q9P1Z2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALCOCO1Q9P1Z2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALCOCO1Q9P1Z2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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