Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms