Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms