Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms