Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms