Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms