Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPS6KC1Q96S38 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms