Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OPALINQ96PE5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms