Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT4

LINC01600, Uncharacterized protein encoded by LINC01600, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01600Q96MT4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01600Q96MT4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms