Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms