Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FGD4Q96M96 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FGD4Q96M96 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms