Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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ZNF548Q8NEK5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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ZNF548Q8NEK5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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ZNF548Q8NEK5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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