Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms