Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L2Q8NAA4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG16L2Q8NAA4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms