Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5M4

TTC9C, Tetratricopeptide repeat protein 9C, humanhuman

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9CQ8N5M4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TTC9CQ8N5M4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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