Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HECW1Q76N89 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECW1Q76N89 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms