Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms