Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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