Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms