Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP9Q5VTM2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP9Q5VTM2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP9Q5VTM2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP9Q5VTM2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGAP9Q5VTM2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms