Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 NBPF3-203ENST00000342104 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms