Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms