Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms