Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms