Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms