Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms