Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms