Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPPQ16740 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms