Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms