Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms