Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TCEA2Q15560 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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