Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF11Q15544 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms