Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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