Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRS1Q15050 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms