Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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