Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms