Protein–RNA interactions for Protein: Q14677

CLINT1, Clathrin interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLINT1Q14677 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLINT1Q14677 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLINT1Q14677 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms