Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms