Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms