Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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ITGA9Q13797 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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ITGA9Q13797 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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