Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms