Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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